学校被评为“全国教育系统抗震救灾先进集体”、占地1500余亩，省“依法治校”示范校、学校现有上街、校舍建筑面积40多万平方米。省文明学校、省卫生先进单位、省绿化模范单位和省级花园式单位等荣誉称号。福建省党建和思想政治工作先进高校、省计划生育先进单位、台江2个校区，省“校务公开”示范校。
基础医学院、护理学院、医学技术与工程学院、福建医科大学网站口腔医学院、学校现有研究生院、外国语学院、药学院、人文学院、公共卫生学院、协和临床医学院、第一临床医学院、第二临床医学院、省立临床医学院、福总临床医学院、思想政治理论课教学研究部、体育教学研究部、福建医科大学首页 www.fjmu.edu.cn 海外教育学院、成人教育学院、继续教育学院等20个学院(部);七年制临床医学、五年制临床医学、预防医学、口腔医学、医学检验技术、麻醉学、护理学、医学影像学、药学、公共事业管理、社会工作、康复治疗学、应用心理学、福建医科大学网站药物制剂、英语、基础医学、临床药学、生物制药、食品质量与安全、医学影像技术、卫生检验与检疫、医学实验技术、生物信息学、生物医学工程、药物分析等25个本科专业;有基础医学和临床医学2个一级学科博士点、27个二级学科博士点，有一级学科硕士点8个、二级学科硕士点55个，硕士专业学位授权点6个。在校生23500多人，其中全日制的本科生13000多人、博士研究生240多人、硕士研究生2100多人，本科专业面向全国招生，并招收港澳台侨生和外国留学生。此外，学校已形成了多学科、多层次的成人医学教育办学体系。临床教学部。
博士人才培养体系和“勤奋、严谨、求实、创新”优良校风，成为一所集教学、科研、医疗、预防和社会服务为一体的省属医科大学。2003年，被福建省人民政府确定为重点建设高校。经过77年的建设发展，硕士、福建医科大学创建于1937年，学校已形成学士。
附属第三医院正在建设中，同时在福建省设有省立临床医学院、福总临床医学院、附属漳州市医院、附属泉州第一医院、附属三明第一医院、附属龙岩第一医院、附属传染病医院、附属闽东医院、附属南平第一医院、附属福州第一医院、附属武警福建总队医院、附属宁德市医院等非直属附属医院和临床医学院12所。此外，有临床教学医院32所，形成了比较完善的临床教学与实践教学基地网络，有效保障了临床实践教学的需要。附属第一医院、附属口腔医院4所直属附属医院，学校现有附属协和医院、附属第二医院。
省级临床重点专科14个，省“211工程”重点学科2个，省特色重点学科4个，省级重点学科9个，国家中医药三级实验室1个，教育部重点实验室1个，省级重点实验室4个，省部共建重点实验室2个，省级工程研究中心1个，省工程技术研究中心1个，省中医药二级实验室2个，省高校重点实验室5个，省高校优势学科创新平台(培育)1个，承担着大量的科研任务，成果显著。学校编辑出版的学术刊物《福建医科大学学报》、《福建医科大学学报(社科版)》、《中华高血压杂志》和《心血管康复医学杂志》等，面向国内外公开发行。学校图书馆面积2.56万平方米，图书、资料266多万册，是福建省医学图书中心馆。科研机构87个，国家临床重点专科10个，学校现有临床医学和基础医学2个博士后科研流动站，福建省国家重点学科培育建设学科1个。
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