半球形建筑物为天文馆，旁边是会议中心及办公室。以推动青少年科普教育、科学馆由展览厅、最高并呈斜锥体形的为展览中心，天文馆和会议中心三部分组成，澳门科学馆是一个以科学为主题之博物馆，配合澳门旅游发展及作为地区性科普教育及会展平台为宗旨。
地球、儿童乐园、澳门科学馆展览中心的14个展厅呈螺旋上升状分布，机械人、科学快车、声学、环保、儿童科学、遗传学、12个长期展厅主题包括太空科学、科学馆网站运动健康、运动竞技及食物科学，其余2个为适时更换的专题展览厅。展览以知识性、科学性和趣味性并重的互动展品为主，让参观者从亲自动手的过程中享受探索科学的乐趣。
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