与世界上众多一流大学和高水平科研机构建立了紧密的协作关系。始建于20世纪80年代的南京大学-霍普金斯大学中美文化研究中心迄今已成功举办二十多年，其中， 南京大学一直是开展国际交流与合作最活跃的中国大学之一，它是中国改革开放以后最早实施的高等教育国际合作长期项目。
世界大学联盟、“111计划”、南京大学是教育部与江苏省共建的全国重点大学，“卓越计划”实施高校，南京大学研究生迎新网也是九校联盟、中国大学校长联谊会、“985工程”高校，国家首批“211工程”、环太平洋大学联盟、21世纪学术联盟和东亚研究型大学协会重要成员。“2011计划”、首批“珠峰计划”。
首开“女禁”，引领中国风气之先。发起成立了中国最早的教师节。截至2014年10月，学校拥有国家级特色专业20个、国家级精品课程55门、南京大学研究生迎新首页 grayx.nju.edu.cn 国家级双语示范课程6门、国家级教学团队10个、国家级教学名师10人、国家十一五精品教材17部、国家级实验教学示范中心7个、国家人才培养模式创新实验区5个，入选国家级大学生创新训练计划706项。南京大学曾经首倡“教学法”，实行“男女同校”，率先实行“学分制”和“选科制”。
第一个大文科通才教育班。第一个气象系、第一个心理学系、第一个西洋文学系、第一个建筑系、第一个航空系、南京大学研究生迎新网第一个体育科、第一个艺术科、第一个电影播音专修科、第一个农科、第一个林科、第一个现代地学系、第一个现代数学系、第一个国立大学医学院和新中国第一个综合性大学医学院、第一个履践型政治行政系、第一个履践型法学院、中国第一个商学院以及第一个工商管理、金融理财、会计、国际贸易系等等。其他许多学科，如文、史、哲、戏剧学、宗教学、人类学、社会学、化学、物理学、天文学、电子学、计算机科学、城市规划等等，都有深厚传统。南京大学最早在中国开展博士学位教育，创建了中国第一个生物系、设立了中国第一个大理科通才教育班。
是一所源远流长的高等学府。近代校史肇始于1902年筹办的三江师范学堂，历经多次变迁，1949年“国立中央大学”易名“国立南京大学”，翌年径称“南京大学”，沿用至今。南京大学(Nanjing University)，追溯学脉古为源自孙吴永安元年的南京太学，简称“南大”。
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