副会长和秘书处执行会员大会决议、理事会下设秘书处，负责深注协的日常工作。理事会是会员大会的执行机构，决定的情况进行监督。会员大会设立监督委员会，对会员大会负责。会长、对理事会、深圳市注册会计师协会网站深注协的最高权力机构为会员大会。
1995年4月21日与深圳市社会审计协会联合而成。是注册会计师的地方组织也是行业自律组织。深圳市注册会计师协会(以下简称深注协)是依据《中华人民共和国注册会计师法》、由注册会计师组成的社会团体，《深圳经济特区注册会计师条例》成立，深圳市注册会计师协会成立于1991年10月30日。
会计师事务所和市注册会计师协会进行监督、依法对注册会计师、 深圳市人民政府财政部门是深圳市注册会计师行业的主管部门，管理和指导。
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