随着国家对“京津冀协同发展”工作的推进，我院已与14家河北省医疗机构建立了技术合作关系。医院对外合作医疗机构65家，涉及包括四川、青海、新疆、宁夏、内蒙古、云南、湖北、山西、山东、河南、河北以及京郊区县等地区，其中，在北京地区对顺义、延庆、平谷和怀柔四家中医医院进行托管。
中药房常备中药饮片近660种，诸多院内制剂来源于名老中医及专家的验方、秘方和科研成果，现有批准文号的院内制剂192种，北京中医医院官网其中中药制剂164种，丸、散、膏、颗粒、胶囊、洗剂、酊剂、油剂等近20种剂型，70余种为临床常用制剂。配备大型医疗设备近50种：如3.0T磁共振仪、256层极速CT、数字平板血管造影系统、SPECT/CT、超声内镜、双板数字DR、心脏三维标测系统、全自动智能采血系统、全数字平板乳腺摄影系统、聚焦超声肿瘤消融机、数字胃肠造影系统、彩色超声诊断系统、术中CT、全自动生化分析仪等现代化医疗设备。病房煎药室始终保留一人一方，直火砂锅煎药的传统煎药模式。医院设立有6个医技科室：放射科、核医学科、病理科、医学检验科（包含输血科）、超声诊断科、营养科。
医院下设北京市中医研究所、北京市中医国际交流培训中心、北京市赵炳南皮肤病研究中心等，是首都医科大学中医药临床医学院、北京中医药大学教学医院、北京市中医住院医师（全科医生）规范化培训基地。北京中医医院始建于1956年，首都医科大学附属北京中医医院首页http://www.bjzhongyi.com，是北京市的一所市属综合性、现代化三级甲等中医医院，承担着北京市中医医疗、教学、科研、预防等任务。
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