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49个硕士学位授权一级学科点，教育学、经济学、文学、东南大学研究生院拥有33个博士学位授权一级学科点，工学、法学、医学、覆盖了13个学科门类中的哲学、管理学、艺术学等10个门类。东南大学研究生院，截至2018年11月， 已授予博士学位7445名，硕士学位58946名。理学。
博士学位授予权的高校之一。东南大学党委研究生工作部，东南大学自1952年开始招收研究生，是首批获学士、硕士、现有博士研究生指导教师925人，硕士研究生指导教师2151人，两院院士12人。
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