育种和良繁体系完整，其中育种中心4200㎡，育种团队八人，核心育种田50亩，三圃田80亩，在147团建有600亩原原种良繁和中试基地。惠远种业在北泉镇农业园区征地210亩，投资过亿元建有两条棉种加工生产线，年加工能力1万吨。
公司经营实行总经理负责制，设有综合管理部、惠远种子官网研发中心、良繁部、销售服务部、种子加工厂、财务部等部门。公司由27名自然人股东和一个国有企业法人股东现金出资组成，股东大会为公司决策机构，设有董事会和监事会。新疆惠远种业股份有限公司成立于2010年12月，是一家国有参股民营企业。
惠远种业目前是育繁推一体化的棉种公司，公司的棉花研究所自育了新陆早28号、48号、59号、72号、惠远720等5个棉花品种，与兵团农科院合作选育了新陆早40号、42号、45号、51号4个棉花品种，惠远首页http://huiyuanseed.com，其中：新陆早48号、新陆早51号和惠远720为国审棉品种。
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