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河道、现为其参股的高新技术企业，南京中科水治理股份有限公司成立于1997 年，凭借先进的技术理念及多年在湖泊、首创了全球独有的“清水型生态系统构建系列技术”。水库等水体的生态治理工程经验，原属中科院南京地理与湖泊研究所全资子公司。
●湖泊、水库、河道的生态治理、环保疏浚、水质净化
●园林工程和绿化景观工程内水系的设计施工
●防水、防渗施工及技术服务
●水污染治理技术研发与服务、工程施工
●水生动植物种养殖、销售
●土壤复垦与生态改良
南京中科水治理以恢复生态学为基础，稳态转换理论为指导，生物操控为方向（生物操控包括植物、动物、微生物操控，南京中科水治理专利都围绕其开展，专利涉及基因的遴选、苗种培育、移植技术、养殖技术、优势种群确立、系统稳定管理等），研发了清水型生态系统构建技术和长效运行管理措施，并与相关工程措施集成为系列，为目标水体的水质改善与保护提供解决之道。
清水型生态系统构建技术是集物理、化学、生物多学科为一体的综合性运用工程技术。这种技术的诞生经历了南京中科水治理多年的钻研与实践，2002-2004年南京中科水治理将其自身的发展与环境保护工作紧密结合，把科研院校的成果转化应用到工程实践中，通过在长期摸索以及探索实践中，积累了大量的工程实践经验，南京中科水治理获得了大量有价值的数据以及参数依据，为清水型生态系统构建技术的研发提供了数据参考以及思路；2005-2008年，南京中科水治理通过将技术研发与工程实践有目的的相结合，在工程实践的基础上带动技术研发，以技术研发促进工程质量的提高，二者之间相辅相成，初步形成清水型生态系统构建技术的技术工艺路线；2009-2011年，通过对大量工程实践的验证，南京中科水治理提高技术的完整性以及技术应用范围的扩展，研发总结出了能够解决多种类型水体污染问题的集成技术。
清水型生态系统构建技术先进性：
（1）遵循地球生态圈的演变规律，人工干预为辅助，强化目标水体的生态自我修复；
（2）弱化理化技术手段，充分考虑物种的竞争关系，保障区域的生态安全；
（3）通过生物生命周期的循环，将营养盐得到持久转化，工程措施长效运行；
（4）贴切国内高污染负荷的环境状况，在黑臭水体治理、尾水提标生化、水源地水质的保护、海绵城市的建设工作中都有广泛地应用； 【4】
南京中科水治理属中国科学院南京地理与湖泊研究所的科技开发机构，由高级工程师、有突出贡献的、享受国家津贴的科技干部、曾被评为“中国科学院优秀青年”的马亦兵总经理领导，主要负责科研技术的实践。
中国科学院南京地理与湖泊研究所的前身是中国地理研究所，1940年8月在重庆北碚成立。 南京地理与湖泊研究所是全国*以湖泊—流域系统为研究对象的综合研究机构，于 2001年8月进入中国科学院知识创新工程试点单位序列。研究所的战略定位是：瞄准国家在湖泊及流域资源合理开发、生态环境建设和经济可持续发展等方面的迫切需求，以湖泊—流域系统为核心，在湖泊资源与环境、湖泊—流域相互作用、流域发展与管理三大领域，开展原创性与应用基础性研究，为我国湖泊资源的合理利用与生态环境改善、流域可持续发展提供决策依据与关键技术。
研究所现设中国科学院湖泊沉积与环境重点实验室、湖泊资源与环境研究室、流域管理与模拟实 验室、地理信息科学研究室、太湖湖泊生态系统研究站（国家重点野外科学观测试验站、中国科学院生态网络实验站）。
1、 惠州西湖水质改善及水生态系统构建示范工程
3、 广西玉林苏烟水库水华控制工程
4、麓湖起步区清水型生态系统构建工程(丘陵陆生系统转变为清水景观湖)
麓湖是国内目前单体面积较大的、由丘陵生态系统转变为清水型生态系统的人工湖，麓湖起步区水面面积37万㎡，平均水深2.5米左右。2012年8月24日生态工程验收，水体透明度达到2.31m，叶绿素a≦10ug/L，水体清澈景观好，水质主要指标达到GB3838-2002 Ⅲ类标准。为国内新开挖水体生态建设开辟了先河。
5、溱湖国家湿地公园水域清水型生态系统构建示范工程(5A级国家湿地公园)
溱湖示范区水面面积约80000平方米， 水深1.0-1.5米，透明度仅为25cm。污染负荷主要来自于鱼类扰动沉积物、干湿沉降和地表径流，且与河道相连，有一定量的河流污染进入。水生植被覆盖率70%左右，水体平均透明度100cm以上，浮游生物量减少叶绿素a平均低于10ug/L，总悬浮物平均低于15mg/L，形成稳定的良性生态系统。
南京中科水治理股份有限公司 是国内少数掌握了水生态修复技术的企业，因拥有自主知识产权和专利，并有中国科学院等科研机构做技术支撑，其在相关行业中处于领军地位，被认定为资源与环境技术领域内的高新技术企业代表。
2014年12月17日，南京中科水治理股份有限公司成功登陆全国中小企业股份转让系统，正式成为一家公众公司（证券简称：水治理 证券代码：831511）。
南京中科水治理的经营理念是满足客户需求、细心、细心、再细心; 要求员工爱国、爱企、爱家，有责任心和上进心，认同公司的理念。企业文化是珍惜每一刻，快乐每一天。
目前南京中科水治理主营业务分为两大板块——水环境治理工程、防水防渗工程。水环境治理工程包含水质改善、水生态系统构建、湿地建造、河道污染治理、湖库藻华削减控制、湖库重点区域水质保护等。防水防渗工程包含垃圾集中填埋场防渗、隧道和地下设施防漏、人工景观水体保水防漏等。
南京中科水治理在国内成功案例的长久稳定性、规模、数量、质量、种类等方面都处在领先地位，技术先进完整配套，从基础调研、规划设计到施工维护能独立完成。
2016年，南京中科水治理股份有限公司获得较具投资潜力新三板挂牌公司、中国新三板诚信企业。
2015年，南京中科水治理股份有限公司获得南京市信用管理示范企业。
2015年，南京中科水治理股份有限公司获得南京市守合同重信用企业、江苏省环保治理优秀企业、环境治理示范单位、和谐劳动关系模范企业、南京市认定企业技术中心；
2015年，南京中科水治理股份有限公司获得国家环保部颁发的 “环境保护科学技术”一等奖； 【3】
2014年，南京中科水治理股份有限公司获得江苏省质量安全管理AAA优秀施工企业；
2011年，南京中科水治理股份有限公司被评为国家高新技术企业；
2010年获全国高科技产业品牌推进创新发展专业委员会；全国建筑业质量安全管理优秀企业；CHCBI全国工程建设质量安全调查中心。
2009年获江苏建筑市场质量安全跟踪调查委员会；江苏省安全生产文明施工管理先进单位；江苏建设工程科技成果应用评定委员会。
2008年获由南京建筑防水保温行业协会颁发的南京建筑防水行业先进企业。
2007年获由南京安全生产教育协会颁发的企业安全生产先进单位。
2006年获由南京市工商行政管理局颁发的重合同守信用企业。
2004年获由南京市建筑工程局颁发的先进企业颁发；由南京环境保护产业协会颁发的团体会员单位。
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