与铁道部“脱钩”，组建中国铁路工程总公司。后变更为铁道部基本建设总局。中国中铁官网，2003年4月归属国务院国资委管理。2006年11月，成为首批国有独资企业董事会试点企业。2007年9月12日，中国铁路工程总公司独家发起设立中国中铁股份有限公司，并于2007年12月3日和12月7日，分别在上海证券交易所和香港联合交易所挂牌上市。截至2012年底，职工总数为287813人，其中在岗职工234219人，中国中铁官网·首页管理人员154528人。中级职称及以上专业技术人员56095人，股份公司高级专业技术人才达到14294人，其中：教授级高级工程师971人，高级工程师9326人，高级会计师919人，高级经济师971人。拥有高层次技术专家644人，其中中国工程院院士3 名、国家级突出贡献专家5名、国家勘测设计大师5 名、享受国务院政府特殊津贴专家人员285名。铁道部撤销基本建设总局，整体移交中央大型企业工作委员会管理。1989年7月，中国中铁股份有限公司的前身是1950年3月成立的铁道部工程总局和设计总局，中国中铁官网，2000年9月。
拥有下属子、分公司48家和其它项目机构，主要分布在全国除台湾省以外的各省、市、自治区，中国中铁股份有限公司是中国铁路工程总公司经营业务的运营主体，并在60多个国家和地区设有公司办事处、代表处和项目部等境外机构。具体包括中铁一局、二局、三局、四局、五局、六局、七局、八局、九局、十局、大桥局、隧道、电气化局、建工、港航局、航空港、上海局等17家施工企业集团；中铁二院、设计咨询、大桥院、西北院、西南院、华铁咨询等6家勘察设计科研企业；中铁山桥、宝桥、科工、装备等4家工业制造企业；中海外、中铁国际、委内瑞拉分公司、老挝分公司、东方国际分公司等5家国际业务公司；以及中铁置业、资源、信托、物贸、交通投资、建设投资、海西投资、中原投资、成都投资、昆明投资、青岛投资、北方投资和建设分公司等10余家房地产、金融、投资管理公司。
