菏泽市科普教育基地，位于菏泽市华英路537号，菏泽市爱国主义教育基地，建筑面积4000多平方米，占地面积13000平方米，是山东省爱国主义教育基地、菏泽市博物馆是我市唯一的国家三级博物馆，山东省科普教育基地、展厅面积2000多平方米，菏泽市文明单位。
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菏泽市博物馆现有藏品总数为8763件，其来源有征集、收购、考古发掘品
移交、社会捐赠等渠道，分为陶器、瓷器、金属器、书画、玉器、古籍善本、杂项等七大类。
菏泽市博物馆的基本陈列为《菏泽市馆藏文物精品展》，陈列面积
296平方米，共分为陶器、瓷器、青铜器、玉器、杂项等五部分，共展出藏品近百件。其中较为重要的展品有宰甫卣（晚商）、鎏金佛像（北齐）等。晚商青铜酒器宰甫卣，蘑菇形钮盖，盖顶、器腹饰兽面纹，盖沿、圈足饰夔纹、兽面纹，提梁饰勾连纹，两端饰牛首。器盖和器底内壁对铭三行23字 ，大意是，殷王自豆麓狩猎归来宴飨时，赏给宰甫五串贝，宰甫因作此器以志其事。其他长期专题陈列主要有《菏泽市木版年画展》，陈列面积296平方米、《菏泽市博物馆馆藏书画展》，陈列面积296平方米。
1967年，原菏泽地区革命委员会决定在菏泽城东关外路北城墙以 东、原地区印刷厂路南建设“菏泽地区毛泽东思想胜利万岁展览馆”，三层，建筑面积1800平方米。1969年竣工，1971年原菏泽地区革命委员会决定将大楼改为菏泽宾馆，1972年更名为菏泽地区展览馆。1980年6月，菏泽地区展览馆与菏泽
地区文物管理站合并成立菏泽地区文展馆，1985年1月，菏泽地区文展馆更名为菏泽地区博物馆。1991年12月菏泽地区博物馆选址建设新馆，1996年4月正式开馆。2000年菏泽地区撤地改市，菏泽地区博物馆遂更名为菏泽市博物馆。
1999年9月29日至10月20日举办的《辉煌的历程——菏泽地区50年建设成就回顾展》获山东省文化厅颁发的庆祝建国50周年“一馆一展”评比活动优秀奖和菏泽地委、行署颁发的“庆祝建国50周年活动组织奖”。2002年8月，来自德国、意大利、罗马尼亚、奥地利、土耳其等国家的画家、雕塑家及来自北京、济南等地国内部分知名画家，在菏泽市博物馆举办了《中外艺术家迎奥运绿色行动菏泽行画展》。自2003年举办首届起，至2008年菏泽市博物馆已成功承办了6届“牡丹杯”全国书画名家作品展。
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